Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfrsf25B1AWN9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfrsf25B1AWN9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfrsf25B1AWN9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms