Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GLTPD2A6NH11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLTPD2A6NH11 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms