Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbp4A4UUI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbp4A4UUI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms