Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psma1Q9R1P4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psma1Q9R1P4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms