Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L1Q9NU39 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L1Q9NU39 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms