Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Msrb1Q9JLC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Msrb1Q9JLC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms