Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PREBQ9HCU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PREBQ9HCU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms