Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC90BQ9GZT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC90BQ9GZT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms