Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
2310002L09RikQ9D7L5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
2310002L09RikQ9D7L5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
2310002L09RikQ9D7L5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
2310002L09RikQ9D7L5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
2310002L09RikQ9D7L5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms