Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc83Q9D4V3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc83Q9D4V3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms