Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Arv1Q9D0U9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Arv1Q9D0U9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms