Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm5Q9CXE0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms