Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PHACTR1Q9C0D0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHACTR1Q9C0D0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms