Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab27bQ99P58 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab27bQ99P58 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms