Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gins4Q99LZ3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gins4Q99LZ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms