Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC138Q96M89 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms