Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RABGGTAQ92696 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABGGTAQ92696 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABGGTAQ92696 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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