Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAF3IP1Q8TDR0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF3IP1Q8TDR0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms