Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
9030612E09RikQ8CE20 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9030612E09RikQ8CE20 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9030612E09RikQ8CE20 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9030612E09RikQ8CE20 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9030612E09RikQ8CE20 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
9030612E09RikQ8CE20 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms