Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc169Q8BXX9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms