Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZD4Q76G19 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDZD4Q76G19 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZD4Q76G19 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms