Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csnk2a1Q60737 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a1Q60737 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms