Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP9Q5VTM2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP9Q5VTM2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms