Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r196Q5SVD5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms