Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D130052B06RikQ3UW13 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms