Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A52Q3SY17 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A52Q3SY17 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms