Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB35Q15286 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB35Q15286 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB35Q15286 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB35Q15286 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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RAB35Q15286 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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RAB35Q15286 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB35Q15286 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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