Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX6Q13608 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX6Q13608 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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