Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 CBP2YHL038C 1893 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 BRE1YDL074C 2103 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 SAT4YCR008W 1812 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 ERB1YMR049C 2424 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 NUP192YJL039C 5052 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 MST28YAR033W 705 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 DNL4YOR005C 2835 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 FLO11YIR019C 4104 nt3.04□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 RPS11BYBR048W 471 nt3.03□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 Q0010Q0010 387 nt3.03□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 SEY1YOR165W 2331 nt3.03□□□□□ -1.92
TY2B-BQ12491 IRR1YIL026C 3453 nt3.03□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YDR431WYDR431W 312 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YGR126WYGR126W 693 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 HUG1YML058W-A 207 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 SEF1YBL066C 3447 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 UBR2YLR024C 5619 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 BNI4YNL233W 2679 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 DYN1YKR054C 12279 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 RBK1YCR036W 1002 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YHP1YDR451C 1062 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 ARC19YKL013C 516 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YCG1YDR325W 3108 nt3.02□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 IXR1YKL032C 1794 nt3.01□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 NDT80YHR124W 1884 nt3.01□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 SAP185YJL098W 3177 nt3.01□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 NIC96YFR002W 2520 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 ETP1YHL010C 1758 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YDR209CYDR209C 414 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 LIF1YGL090W 1266 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 RRG8YPR116W 834 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 PUT2YHR037W 1728 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 UBP6YFR010W 1500 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YGR226CYGR226C 210 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YPL142CYPL142C 318 nt3□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 ATG7YHR171W 1893 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 APL4YPR029C 2499 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 KIN82YCR091W 2163 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 SUC2YIL162W 1599 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YGL101WYGL101W 648 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YLL044WYLL044W 447 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YLR365WYLR365W 333 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 MAK21YDR060W 3078 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 ARP5YNL059C 2268 nt2.99□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 DBP7YKR024C 2229 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 GIP1YBR045C 1920 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 RTN1YDR233C 888 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 PCL7YIL050W 858 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 AIM19YIL087C 474 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 SAS2YMR127C 1017 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 TEC1YBR083W 1461 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 RNA14YMR061W 2034 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 LAP2YNL045W 2016 nt2.98□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 TAF2YCR042C 4224 nt2.97□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 ECM1YAL059W 639 nt2.97□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 MET5YJR137C 4329 nt2.97□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 YNL193WYNL193W 1677 nt2.97□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 DEF1YKL054C 2217 nt2.97□□□□□ -1.93
TY2B-BQ12491 FKS1YLR342W 5631 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 PIK1YNL267W 3201 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 ADH4YGL256W 1149 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YKR051WYKR051W 1257 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 SYM1YLR251W 594 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MPH1YIR002C 2982 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 CFT1YDR301W 4074 nt2.96□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 TDA3YHR009C 1572 nt2.95□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 ZDS2YML109W 2829 nt2.95□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MRPL38YKL170W 417 nt2.95□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YAP7YOL028C 738 nt2.95□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YKR015CYKR015C 1707 nt2.95□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 RAD5YLR032W 3510 nt2.95□□□□□ -1.94
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TY2B-BQ12491 RCE1YMR274C 948 nt2.95□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 SPI1YER150W 447 nt2.94□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.94□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt2.94□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 FRM2YCL026C-A 582 nt2.94□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MLH1YMR167W 2310 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MGT1YDL200C 567 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MIX14YDR031W 366 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 ASP1YDR321W 1146 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 PFA5YDR459C 1125 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YJL016WYJL016W 1686 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MIF2YKL089W 1650 nt2.93□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 MMS1YPR164W 4224 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YER133W-AYER133W-A 342 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 GCY1YOR120W 939 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 ATP3YBR039W 936 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 STU1YBL034C 4542 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 SPO1YNL012W 1896 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 IZH1YDR492W 951 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YGR073CYGR073C 372 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YGR168CYGR168C 1131 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YHL037CYHL037C 402 nt2.92□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 TIF4631YGR162W 2859 nt2.91□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 SAK1YER129W 3429 nt2.91□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 YBR139WYBR139W 1527 nt2.91□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 RSN1YMR266W 2862 nt2.91□□□□□ -1.94
TY2B-BQ12491 SET2YJL168C 2202 nt2.91□□□□□ -1.94
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