Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PUDPQ08623 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PUDPQ08623 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms