Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms