Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTK2Q05397 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK2Q05397 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms