Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLCB3Q01970 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLCB3Q01970 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms