Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mc1rQ01727 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mc1rQ01727 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms