Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CDKL1Q00532 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDKL1Q00532 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms