Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEP78395 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms