Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp7P70280 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms