Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem258P61166 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms