Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdh15P33146 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh15P33146 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms