Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC13P31276 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC13P31276 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms