Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HLA-FP30511 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HLA-FP30511 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms