Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHA1P21709 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA1P21709 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms