Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RAP15509 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RAP15509 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms