Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms