Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SparcP07214 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SparcP07214 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SparcP07214 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SparcP07214 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SparcP07214 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SparcP07214 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SparcP07214 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SparcP07214 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SparcP07214 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SparcP07214 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms