Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apoa4P06728 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms