Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF3O43395 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF3O43395 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF3O43395 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms