Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTLC1O15269 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTLC1O15269 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms