Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc8D3YZV8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms