Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhbdl2A2AGA4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl2A2AGA4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms